Para setar as permissões de arquivos e pastas do Magento 2.0 corretamente, basta executar os comandos abaixo:
cd <diretorio_de_instalacao_do_magento> find . -type f -exec chmod 644 {} \; find . -type d -exec chmod 755 {} \; find ./var -type d -exec chmod 777 {} \; find ./pub/media -type d -exec chmod 777 {} \; find ./pub/static -type d -exec chmod 777 {} \; chmod 777 ./app/etc chmod 644 ./app/etc/*.xml chown -R :<grupo_do_server_web> . chmod u+x bin/magento